Родоначалници на неаполитанските мастифи са древните бойни кучета, а промеждутъчно звено в родословното дърво на породата са масивните италиански молоси, описани през I-ви век от агронома Колумела. Тези кучета са се сръжавали заедно с римските легиони, поради което са се разпространили из цяла Европа в пряка зависимост от времете на владичество на Римската империя на съответната територия. Предците на мастино неаполитано участвали в борби на римските гладиаторски арени, а така също били използвани и за лов. Неаполитанският мастиф се явява близък родственик на италианското кане корсо.
Съвременният тип на мастиното възниква през 1947 г., благодарение на усилията на развъдчика Пиеро Сканциани.
